要使用论文查重软件进行文献自动分类，首先需要将文献导入软件中进行分析，软件会根据文献内容和相似度进行分类。接着，可以根据软件提供的分类结果进行进一步的整理和编辑，以便更好地组织文献内容。

另外，在使用论文查重软件进行文献自动分类时，需要注意保持文献的原始性和准确性，避免因软件错误分类导致混淆。同时，及时更新软件版本，以获取更准确的分类结果。